Secretaría Ejecutiva
Es propuesto por el Presidente y designado por el Consejo Directivo. Dura dos años en sus funciones.

Secretario Ejecutivo de Enlaces
Juan Guillermo Hoyos Aristizábal
Es médico cirujano, magíster en Salud Pública y especialista en Gerencia Hospitalaria, con experiencia en consultoría y asesoría en gestión y desarrollo de proyectos para entidades de los sectores educación y salud.
Ha prestado sus servicios a la Asociación Colombiana de Universidades – ASCUN – como coordinador de Relaciones Internacionales, asesor de la Dirección Ejecutiva, miembro del equipo técnico y gestor del programa Retos, responsabilidades desde las cuales ha contribuido con el análisis y la formulación de propuestas de política pública para el sector de la Educación Superior.
Es el Secretario General de la Asociación Colombiana de Universidades desde el año 2019
Facultades y obligaciones del Secretario Ejecutivo.
El Secretario Ejecutivo será propuesto por el Presidente y designado por el Consejo Directivo. Durará dos años en sus funciones. Tendrá las facultades y obligaciones siguientes:
I. Fungir como secretario del Consejo Directivo con voz pero sin voto;
II. Ejecutar los acuerdos del Consejo Directivo;
III. Expedir los manuales de organización y de procedimientos y catálogos de servicios;
IV. Presentar ante el Consejo Directivo para su análisis y, en su caso, aprobación, los proyectos de acuerdos administrativos necesarios para el funcionamiento de la organización;
V. Elaborar y enviar las convocatorias y documentación correspondiente a las sesiones del Consejo Directivo;
VI. Formular y presentar para su aprobación al Consejo Directivo, la propuesta de Plan de Desarrollo Institucional y el Programa Anual de Actividades, así como las reglas de operación de los programas sustantivos, o sus modificaciones;
VII. Someter en la última sesión ordinaria del año el Programa Anual de Actividades y las estrategias de ejecución a consideración del Consejo Directivo y ejercerlo conforme a lo aprobado por dicho órgano colegiado;
VIII. Presentar al Consejo Directivo, en los primeros tres meses del año, un informe sobre las actividades realizadas el año anterior;
IX. Las demás que le asigne el Consejo Directivo que sean necesarias para el cumplimiento de los fines y objetivos de la organización.